当SARS-CoV-2感染一个细胞时,它将其RNA引入细胞,并以这样的方式重新编程,使细胞首先产生病毒蛋白,然后是整个病毒颗粒。在寻找对抗SARS-CoV-2的活性物质时,研究人员迄今主要集中在病毒蛋白和阻断它们,因为这有可能阻止或至少减缓复制过程。但是,攻击病毒基因组(一种长的RNA分子)也可能阻止或减慢病毒的复制。
由法兰克福大学有机化学和化学生物学研究所的Harald Schwalbe教授协调的COVID-19-NMR联盟的科学家们现在已经完成了开发此类新型SARS-CoV-2药物的重要第一步。他们已经确定了SARS-CoV-2基因组的15个短片段,这些短片段在各种冠状病毒中非常相似,并且已知其具有重要的调节功能。在2020年的过程中,这些片段也很少受到突变的影响。
研究人员让一个由768个化学性质简单的小分子组成的物质库与15个RNA片段相互作用,并通过核磁共振谱学分析结果。在核磁共振光谱学中,分子首先被标记为特殊类型的原子(稳定同位素),然后暴露在一个强磁场中。原子核通过一个短的无线电频率脉冲被激发,并发射出一个频率谱,在此帮助下,可以确定RNA和蛋白质的结构以及小分子的结合方式和位置。
这使得Schwalbe教授领导的研究小组能够确定69种小分子与15个RNA片段中的13个结合。Schwalbe教授表示:“其中三个分子甚至只与一个RNA片段特异性结合。通过这一点,我们能够证明SARS-CoV-2 RNA非常适合作为药物的潜在目标结构。鉴于SARS-CoV-2有大量的突变,这种保守的RNA片段,如我们所确定的那些,对于开发潜在的抑制剂特别有趣。而且,由于病毒RNA占受感染细胞中所有RNA的三分之二,我们应该能够通过使用合适的分子在相当大的范围内破坏病毒的复制。”
Schwalbe继续说,在这种背景下,研究人员现在已经开始用现成的物质进行后续试验,这些物质在化学上与物质库中的结合“伙伴”相似。
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