从人骨中提取的古代DNA或改写日本早期的历史：现代人口有三方遗传起源

之前长期存在的假说认为，日本大陆的人口来自于本土的绳文狩猎-采集-捕鱼者，他们在大约16000年至3000年前居住在日本群岛，后来的弥生人从亚洲大陆迁移过来，在公元前900年至公元300年期间居住在日本。

但是，这12个新测序的日本古代基因组–来自于生活在农耕时代之前和之后的人们的骨骼–也确定了后来在帝国的甲午时期东亚血统的涌入，这一时期大约从公元300年持续到700年，见证了日本政治集中化的出现。

都柏林圣三一大学医学院精神病学助理教授Shigeki Nakagome领导了这项研究，该研究汇集了来自日本和爱尔兰的跨学科研究团队。

Nakagome教授称：“随着越来越多的古代文物的出现，研究人员对绳文、弥生和古坟时期的文化了解得越来越多，但是在我们的研究之前，我们对农业转型和后期国家形成阶段的遗传起源和影响了解得相对较少。”

"我们现在知道，来自觅食、农业和国家形成阶段的每个阶段的祖先都对今天日本人口的形成做出了重大贡献。简而言之，我们有了一个全新的日本基因组起源的三方模式–而不是在相当长的时间内一直持有的双重祖先模式。"

对日本关键转变的基因组学见解

除了这一总体发现之外，分析还发现，绳文人在几千年来一直保持着约1000人的小规模有效人口，与大陆人口的深度分化可追溯到2万至1.5万年前–这一时期，由于海平面上升，日本在地理上变得更加闭塞。

在大约2.8万年前的最后一次冰川期开始时，日本群岛可以通过朝鲜半岛进入。而16000年至17000年前，由于海平面的上升，朝鲜海峡的拓宽可能导致了后来绳文人与大陆其他地区的隔离。这些时间框架也与绳纹陶器生产的最古老证据相吻合。

"在随后的弥生时期采用水稻耕作之前的数千年里，日本本土的绳文人拥有自己独特的生活方式和文化。我们的分析清楚地发现他们是一个遗传上独特的群体，所有采样个体之间的关联性异常高–即使是那些年龄相差数千年、从不同岛屿的遗址中挖掘出来的个体，"都柏林圣三一大学的博士研究员Niall Cooke解释说。“这些结果强烈地表明了与大陆其他地区长期隔离的情况。”

农业的传播往往以人口替代为标志，正如在整个欧洲大部分地区的新石器时代过渡时期所记录的那样，在许多地区只观察到来自狩猎-采集者人口的最小贡献。然而，研究人员发现遗传学证据表明，史前日本的农业转型涉及同化过程，而不是替代过程，来自本土绳文人和与湿稻耕作有关的新移民的遗传贡献几乎相等。

一些考古学证据支持在弥生-古坟过渡时期将新的大型定居点引入日本，很可能来自朝鲜半岛南部。这些分析为在这个国家形成阶段出现新的社会、文化和政治特征所涉及的遗传交流提供了强有力的支持。

“日本群岛是世界上一个特别有趣的地方，鉴于其特殊的史前史，即长期的连续性和快速的文化转型，使用古代样本的时间序列来调查。我们对现代日本人的复杂起源的洞察力再次显示了古代基因组学的力量，它可以发现有关人类史前史的新信息，而这些信息以其他方式是无法看到的，”共同领导该项目的都柏林圣三一大学遗传学和微生物学学院人口遗传学教授Dan Bradley补充说。