这篇文章将为大家详细讲解有关circos中connector有什么用,小编觉得挺实用的,因此分享给大家做个参考,希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。
connector
用于展示基因组上两个位置之间的关系,通过一套折线将两个位置连接起来,示例如下
靠近染色体的折线区域就是connector
了。可以看到,connector
也是通过一个圆环区域进行展示,连线的起始位置位于圆环的内径上,终止位置位于圆环的外径上。
配置文件的写法如下
首先看下file
中定义的数据内容
在file
中,,每一行定义了一条连线,第一列是染色体名称,第二列和第三列分别代表连线的起始位置和终止位置,起始点位于r0
上,终止点位于r1
上,示意图如下
connector
的属性比较少,r0
和r1
定义圆环的内径和外径, 决定connector
在图上的位置; thickness
定义连线的粗细,color
定义连线的颜色。
连线的形状由connetor_dim
属性控制,这个数值的值是由5个数值构成的list
, 用法如下
connector_dims = 0.05,0.15,0.6,0.1,0.1
这5个数值将r0
和r1
之间的距离划分成5个区域,数值代表的是每个区域的比例,所以5个数值的和一定为1,示意图如下:··
connector
的用法相对简单,在实际使用中的频率并不高。
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