12月27日，红旗Linux发行商中科红旗员工发出请愿信讨薪，信的内容矛头直指中科红旗最大股东中科院软件所。作为曾经的中国最大Linux操作系统发行商，中科红旗一旦倒下，必将让国产操作系统发行商不甚唏嘘。
红旗Linux，作为国产Linux操作系统的代表，是中国较大也是较成熟的Linux发行版之一。而红旗Linux，或许在即将到来的2014年将正式成为历史。
12月27日，国内Linuxeden开源社区发布了来自红旗Linux发行商——北京中科红旗软件技术有限公司——员工的一封请愿书《风雨飘摇，中科红旗路在何方？》。中科红旗员工在请愿书中表示：“自2013年4月1日开始，由于中科院软件所（编者注：中科红旗股东之一）未兑现承诺支付我公司承担的核高基专项配套资金，致使公司资金链中断，从而停发全员工资至今。”
请愿信中还提到，中科红旗员工已经采取法律维权，在今年10月11日已经完成海淀仲裁院立案，10月22日向中科院北京分院信访办投送呼吁信，11月8日完成海淀法院强制执行立案。但至今仍无法解决涉案职工的欠薪问题。
此外，小编从中科红旗内部人士处了解到，目前中科红旗位于北京海淀区万泉河路68号紫金大厦的总部已经因欠费被停供水电，中科红旗的一切用户服务和正常工作已经停止。
特殊背景下诞生的“红旗Linux”
红旗Linux诞生与1999年8月，当时，中国科学院软件研究所（以下简称“中科院软件所”）发布了基于自由软件Linux研制的自主操作系统红旗Linux 1.0版。红旗Linux诞生的背景也比较特殊，是国家推动操作系统发展的产物。
20世纪90年代初的海湾战争及90年代末的科索沃战争中，信息战几乎瓦解了对手的所有通讯系统。这让中国政府认为拥有自己独立的计算机操作系统及软件将能够使自己在信息战中比较不容易受到攻击。于是，中科院软件所受命研发了红旗Linux操作系统。
2000年6月，中科院研究所和上海联创投资管理有限公司共同组建了北京中科红旗软件技术有限公司。2001年3月，信息产业部（后并入工信部）通过中国电子信息产业发展研究院（CCID）北京赛迪创业投资有限公司向该公司注资。红旗软件董事长由中科院研究所副所长、红旗Linux项目负责人孙玉芳教授出任。
自2001年开始，中科红旗的产品迅速发展。其中，在2001年的北京市政府桌面操作系统产品正版软件采购竞标中，中科红旗将同为竞争对手的微软挤下擂台成功中标。随后几年，中科红旗的产品逐渐得到认可，在政府采购及市场上取得了不错的成绩。同时，也得到了国外厂商的支持。
中科院软件所或是中科红旗走向末路的阿喀琉斯之踵
得益于在政府采购项目中的成功，中科红旗的发展一直不错，业务线也扩展至包括高端Linux服务器操作系统、集群系统、桌面版操作系统、嵌入式系统以及技术支持服务和培训在内的各种领域。
但从“请愿书”及小编了解中科红旗所处的困境看来，中科红旗将不可避免的走向末路。而中科红旗员工讨薪也将矛头指向了其背后的大股东中科院软件所。
小编了解到，中科院软件所旗下从事国产操作系统的企业并非只有中科红旗一家。在与中科红旗内部人士的交流中，他一再提到另一家同属中科院软件所的公司，中科方德。据该人士提供的举报信中资料显示，目前中科院软件所是中科方德的最大持股人，“软件所所长李明树为法人且软件所管理人员占有私人股份”。
而同一屋檐下的两家公司，实际上一直存在隔阂。在2000年成立中科红旗时，中科院软件所与中科红旗之间曾有过一个非竞争协议。而在中科方德公司网站上，公司简介中写着“主要从事国产安全操作系统系列产品、嵌入式系统与应用产品”。中科红旗的员工认为中科院软件所及其所属的公司中科方德违反了当初的非竞争协议。
在2010年的“核高基”重大专项竞标中，中科院软件所、中科红旗及中科方德曾联合入围“核高基”基础软件重大专项。其中，中科红旗承担了“红旗桌面操作系统研发及产业化”项目分课题“通用桌面操作系统研发及产业化”，方德承担了“方德高可信服务器操作系统研发及产业化”项目。这次“核高基”重大专项最终也带来了中科红旗的厄运。
据中科红旗透露，在“核高基”项目中，项目资金来源为三方面：国资拨付、地方配套以及企业自筹。其中，作为中科红旗大股东及项目的联合承担单位，中科院软件曾承诺当中科红旗自筹资金不能按时足额到位时，软件所将予以足额补齐（详见中科院软件所“关于补齐核高基项目配套资金的承诺书及“软所发[2009]59号文件”）。而在项目执行中，中科红旗针对本课题的资金配套出现了缺口时，中科院软件所并未履行承诺。
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