简介
spark一个最重要的特性就是对数据集在各个节点的分区进行控制。控制数据分布可以减少网络开销,极大地提升整体性能。
只有Pair RDD才有分区,非Pair RDD分区的值是None。如果RDD只被扫描一次,没必要预先分区处理;如果RDD多次在诸如连接这种基于键的操作中使用时,分区才有作用。
分区器
分区器决定了RDD的分区个数及每条数据最终属于哪个分区。
spark提供了两个分区器:HashPartitioner和RangePartitioner,它们都继承于org.apache.spark.Partitioner类并实现三个方法。
- numPartitions: Int: 指定分区数
- getPartition(key: Any): Int: 分区编号(0~numPartitions-1)
- equals(): 检查分区器对象是否和其他分区器实例相同,判断两个RDD分区方式是否一样。
HashPartitioner分区
HashPartitioner分区执行原理:对于给定的key,计算其hashCode,再除以分区数取余,最后的值就是这个key所属的分区ID。实现如下:
class HashPartitioner(partitions: Int) extends Partitioner {
require(partitions >= 0, s"Number of partitions ($partitions) cannot be negative.")
def numPartitions: Int = partitions
def getPartition(key: Any): Int = key match {
case null => 0
case _ => Utils.nonNegativeMod(key.hashCode, numPartitions)
}
override def equals(other: Any): Boolean = other match {
case h: HashPartitioner =>
h.numPartitions == numPartitions
case _ =>
false
}
override def hashCode: Int = numPartitions
}
RangePartitioner分区
HashPartitioner分区可能导致每个分区中数据量的不均匀。而RangePartitioner分区则尽量保证每个分区中数据量的均匀,将一定范围内的数映射到某一个分区内。分区与分区之间数据是有序的,但分区内的元素是不能保证顺序的。
RangePartitioner分区执行原理:
- 计算总体的数据抽样大小sampleSize,计算规则是:至少每个分区抽取20个数据或者最多1M的数据量。
- 根据sampleSize和分区数量计算每个分区的数据抽样样本数量sampleSizePrePartition
- 调用RangePartitioner的sketch函数进行数据抽样,计算出每个分区的样本。
- 计算样本的整体占比以及数据量过多的数据分区,防止数据倾斜。
- 对于数据量比较多的RDD分区调用RDD的sample函数API重新进行数据抽取。
- 将最终的样本数据通过RangePartitoner的determineBounds函数进行数据排序分配,计算出rangeBounds。
class RangePartitioner[K: Ordering : ClassTag, V](
partitions: Int,
rdd: RDD[_ <: Product2[K, V]],
private var ascending: Boolean = true)
extends Partitioner {
// We allow partitions = 0, which happens when sorting an empty RDD under the default settings.
require(partitions >= 0, s"Number of partitions cannot be negative but found $partitions.")
// 获取RDD中K类型数据的排序器
private var ordering = implicitly[Ordering[K]]
// An array of upper bounds for the first (partitions - 1) partitions
private var rangeBounds: Array[K] = {
if (partitions <= 1) {
// 如果给定的分区数小于等于1的情况下,直接返回一个空的集合,表示数据不进行分区
Array.empty
} else {
// This is the sample size we need to have roughly balanced output partitions, capped at 1M.
// 给定总的数据抽样大小,最多1M的数据量(10^6),最少20倍的RDD分区数量,也就是每个RDD分区至少抽取20条数据
val sampleSize = math.min(20.0 * partitions, 1e6)
// Assume the input partitions are roughly balanced and over-sample a little bit.
// RDD各分区中的数据量可能会出现倾斜的情况,乘于3的目的就是保证数据量小的分区能够采样到足够的数据,而对于数据量大的分区会进行第二次采样
val sampleSizePerPartition = math.ceil(3.0 * sampleSize / rdd.partitions.size).toInt
// 从rdd中抽取数据,返回值:(总rdd数据量, Array[分区id,当前分区的数据量,当前分区抽取的数据])
val (numItems, sketched) = RangePartitioner.sketch(rdd.map(_._1), sampleSizePerPartition)
if (numItems == 0L) {
// 如果总的数据量为0(RDD为空),那么直接返回一个空的数组
Array.empty
} else {
// If a partition contains much more than the average number of items, we re-sample from it
// to ensure that enough items are collected from that partition.
// 计算总样本数量和总记录数的占比,占比最大为1.0
val fraction = math.min(sampleSize / math.max(numItems, 1L), 1.0)
// 保存样本数据的集合buffer
val candidates = ArrayBuffer.empty[(K, Float)]
// 保存数据分布不均衡的分区id(数据量超过fraction比率的分区)
val imbalancedPartitions = mutable.Set.empty[Int]
// 计算抽取出来的样本数据
sketched.foreach { case (idx, n, sample) =>
if (fraction * n > sampleSizePerPartition) {
// 如果fraction乘以当前分区中的数据量大于之前计算的每个分区的抽象数据大小,那么表示当前分区抽取的数据太少了,该分区数据分布不均衡,需要重新抽取
imbalancedPartitions += idx
} else {
// 当前分区不属于数据分布不均衡的分区,计算占比权重,并添加到candidates集合中
// The weight is 1 over the sampling probability.
val weight = (n.toDouble / sample.size).toFloat
for (key <- sample) {
candidates += ((key, weight))
}
}
}
// 对于数据分布不均衡的RDD分区,重新进行数据抽样
if (imbalancedPartitions.nonEmpty) {
// Re-sample imbalanced partitions with the desired sampling probability.
// 获取数据分布不均衡的RDD分区,并构成RDD
val imbalanced = new PartitionPruningRDD(rdd.map(_._1), imbalancedPartitions.contains)
// 随机种子
val seed = byteswap32(-rdd.id - 1)
// 利用rdd的sample抽样函数API进行数据抽样
val reSampled = imbalanced.sample(withReplacement = false, fraction, seed).collect()
val weight = (1.0 / fraction).toFloat
candidates ++= reSampled.map(x => (x, weight))
}
// 将最终的抽样数据计算出rangeBounds出来
RangePartitioner.determineBounds(candidates, partitions)
}
}
}
// 下一个RDD的分区数量是rangeBounds数组中元素数量+ 1个
def numPartitions: Int = rangeBounds.length + 1
// 二分查找器,内部使用java中的Arrays类提供的二分查找方法
private var binarySearch: ((Array[K], K) => Int) = CollectionsUtils.makeBinarySearch[K]
// 根据RDD的key值返回对应的分区id。从0开始
def getPartition(key: Any): Int = {
// 强制转换key类型为RDD中原本的数据类型
val k = key.asInstanceOf[K]
var partition = 0
if (rangeBounds.length <= 128) {
// If we have less than 128 partitions naive search
// 如果分区数据小于等于128个,那么直接本地循环寻找当前k所属的分区下标
while (partition < rangeBounds.length && ordering.gt(k, rangeBounds(partition))) {
partition += 1
}
} else {
// Determine which binary search method to use only once.
// 如果分区数量大于128个,那么使用二分查找方法寻找对应k所属的下标;
// 但是如果k在rangeBounds中没有出现,实质上返回的是一个负数(范围)或者是一个超过rangeBounds大小的数(最后一个分区,比所有数据都大)
partition = binarySearch(rangeBounds, k)
// binarySearch either returns the match location or -[insertion point]-1
if (partition < 0) {
partition = -partition - 1
}
if (partition > rangeBounds.length) {
partition = rangeBounds.length
}
}
// 根据数据排序是升序还是降序进行数据的排列,默认为升序
if (ascending) {
partition
} else {
rangeBounds.length - partition
}
}
影响分区的算子操作
影响分区的算子操作有:cogroup()、groupWith()、join()、leftOuterJoin()、rightOuterJoin()、groupByKey()、reduceByKey()、combineByKey()、partitionBy()、repartition()、coalesce()、sort()、mapValues()(如果父RDD有分区方式)、flatMapValues()(如果父RDD有分区方式)。
对于执行两个RDD的算子操作,输出数据的分区方式取决于父RDD的分区方式。默认情况下,结果会采用哈希分区,分区的数量和操作的并行度一样。不过,如果其中一个父RDD设置过分区方式,结果就采用那种分区方式;如果两个父RDD都设置过分区方式,结果RDD采用第一个父RDD的分区方式。
repartition和partitionBy的区别
repartition 和 partitionBy 都是对数据进行重新分区,默认都是使用 HashPartitioner。但是二者之间的区别有:
- partitionBy只能用于Pair RDD
- 都作用于Pair RDD时,结果也不一样
其实partitionBy的结果才是我们所预期的。repartition 其实使用了一个随机生成的数来当作 key,而不是使用原来的key。
def repartition(numPartitions: Int)(implicit ord: Ordering[T] = null): RDD[T] = withScope {
coalesce(numPartitions, shuffle = true)
}
def coalesce(numPartitions: Int, shuffle: Boolean = false)(implicit ord: Ordering[T] = null)
: RDD[T] = withScope {
if (shuffle) {
/** Distributes elements evenly across output partitions, starting from a random partition. */
val distributePartition = (index: Int, items: Iterator[T]) => {
var position = (new Random(index)).nextInt(numPartitions)
items.map { t =>
// Note that the hash code of the key will just be the key itself. The HashPartitioner
// will mod it with the number of total partitions.
position = position + 1
(position, t)
}
} : Iterator[(Int, T)]
// include a shuffle step so that our upstream tasks are still distributed
new CoalescedRDD(
new ShuffledRDD[Int, T, T](mapPartitionsWithIndex(distributePartition),
new HashPartitioner(numPartitions)),
numPartitions).values
} else {
new CoalescedRDD(this, numPartitions)
}
}
repartition和coalesce的区别
两个算子都是对RDD的分区进行重新划分,repartition只是coalesce接口中shuffle为true的简易实现,(假设RDD有N个分区,需要重新划分成M个分区)
- N<M。一般情况下N个分区有数据分布不均匀的状况,利用HashPartitioner函数将数据重新分区为M个,这时需要将shuffle设置为true。
- 如果N>M并且N和M相差不多(假如N是1000,M是100),这时可以将shuffle设置为false,不进行shuffle过程,父RDD和子RDD之间是窄依赖关系。在shuffle为false的情况下,如果N<M时,coalesce是无效的。
- 如果N>M并且两者相差悬殊,这时如果将shuffle设置为false,父子RDD是窄依赖关系,同处在一个Stage中,就可能造成spark程序的并行度不够,从而影响性能。如果在M为1的时候,为了使coalesce之前的操作有更好的并行度,可以将shuffle设置为true。
实例分析
需求
统计用户访问其未订阅主题页面的情况。
- 用户信息表:由(UserID,UserInfo)组成的RDD,UserInfo包含该用户所订阅的主题列表。
- 事件表:由(UserID,LinkInfo)组成的RDD,存放着每五分钟内网站各用户访问情况。
代码实现
val sc = new SparkContext()
val userData = sc.sequenceFile[UserID,LinkInfo]("hdfs://...").persist
def processNewLogs(logFileName:String){
val events = sc.sequenceFile[UserID, LinkInfo](logFileName)
//RDD of (UserID,(UserInfo,LinkInfo)) pairs
val joined = usersData.join(events)
val offTopicVisits = joined.filter {
// Expand the tuple into its components
case (userId, (userInfo, linkInfo)) =>
!userInfo.topics.contains(linkInfo.topic)
}.count()
println("Number of visits to non-subscribed opics: " + offTopicVisits)
}
缺点
连接操作会将两个数据集中的所有键的哈希值都求出来,将哈希值相同的记录通过网络传到同一台机器上,然后再对所有键相同的记录进行连接操作。userData表数据量很大,所以这样进行哈希计算和跨节点数据混洗非常耗时。
改进代码实现
val userData = sc.sequenceFile[UserID,LinkInfo]("hdfs://...")
.partionBy(new HashPartiotioner(100))
.persist()
优点
userData表进行了重新分区,将键相同的数据都放在一个分区中。然后调用persist持久化结果数据,不用每次都计算哈希和跨节点混洗。程序运行速度显著提升。
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