9月14日，国家卫健委最新通报，9月13日0-24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增本土确诊病例59例。其中莆田市24例、泉州市3例、厦门市32例。
至此，从9月10日发现疫情到9月13日，短短4天，福建省已累计报告本土确诊病例102例，无症状感染者21例，共计感染者123例。
此次疫情已形成了以“一个小学”（铺头小学）、“一个鞋厂”（协胜鞋厂）为中心的两条传播链。
根据莆田市疫情防控发布会公布的感染者流调信息统计，有19名为仙游县枫亭镇铺头小学学生，有24人在仙游县枫亭村协胜鞋厂上班，其中有4人居住在泉州。
9月12日，厦门市通过对莆田市仙游县枫亭镇等中高风险地区来厦人员进行筛查，发现1名来厦人员吴某某新冠病毒核酸检测阳性。经核实，吴某某是莆田市报告病例王某某的密切接触者。
9月13日晚，厦门市召开疫情防控新闻发布会上介绍，目前与吴某某有关联的感染者10人，均为确诊病例。这10个病例均在隔离酒店中发现的。经专家初步判定，均为吴某某同一工厂的密切接触者，属于同一传播链条。
据央视新闻最新报道称，福建省莆田市疫情防控新闻发布会通报情况显示，截至13日24时，莆田此轮疫情累计报告85例核酸阳性，其中确诊病例64例、无症状感染者21例。此外，85名阳性病例中，10岁以下儿童共有30人。
截至9月13日24时，莆田市共完成85例阳性病例的流行病学调查，累计排查密切接触者1770人，次密接1866人。截至9月13日24时，莆田市核酸检测共采样874586人份样本，已基本完成检测。
9月13日，兰州大学《新冠肺炎疫情全球预测系统》公布了对此轮新冠肺炎疫情的预测结果。结果显示，如果采取的及时、有效的二级管控措施下，本轮疫情预计将于9月26日左右得到控制，累计确诊病例数预计约268人。
若有传染链未被及时发现，结果则相距甚远。预测显示，若采取三级管控措施，或者仍有未发现的传染链，本轮疫情预计在10月4日左右得到控制，累计确诊病例数或将达到529人左右。
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